亲子鉴定有三种方法：一是血型鉴定。
血型检测亲子鉴定是通过血型的核对和比较来确认亲子关系。根据19世纪末确认的孟德尔遗传定律，人们认识到人类血型是根据遗传基因遗传给下一代的，所以父母具有一定血型所生的孩子也有相应的血型，这为亲子关系的血型鉴定奠定了基础。
二、染色体多态性鉴定。
20世纪80年代，医学家首创了利用染色体多态性识别亲子关系的技术。染色体多态性，又称异态，是指正常人常见的染色体形态的各种微小变异(如增大、重复或无伴体、荧光强度随比粒区，变化等)。)，这是可以继承的。
这种技术是用它的形式来识别亲子关系，依赖于技术人员的主观判断，准确性不尽如人意。
第三，DNA鉴定。
目前，DNA分型是鉴定亲子关系最广泛使用的方法。人的血液、毛发、唾液、口腔细胞、骨骼都可以用来做亲子鉴定，非常方便。
一个人有23对(46条)染色体，同一对染色体上同一位置的一对基因称为等位基因，通常一个来自父亲，一个来自母亲。如果检测到一个DNA基因座的等位基因，一个和母亲一样，另一个应该和父亲一样，否则，就有疑问了。
